研究分野の概略

EMPreSS（Epithelial Mesenchymal Precision Spectrum Scoring：上皮間葉精密スペクトラムスコアリング）は、上皮性質と間葉性質という二元的な視点を超えて、これらの状態を評価する手法です。その目的は、上皮の特徴やより精密な「間葉性」、およびこの二つの状態間の移行を定義することにあります。私たちの研究室では、EMTをスペクトラムとして捉え、流体移動効果、ゲノム高次構造、空間情報解析を通じて、スペクトラム上に存在する両者の不均一性を探求しています。

研究内容の紹介

細胞の複雑性を解き明かす：EMPreSSによる上皮間葉スペクトラムの理解

我々のEMT（Epithelial Mesenchymal Transition：上皮間葉転換）研究は、13,000を超える癌遺伝子発現プロファイルの広範な解析を通じて、上皮系または間葉系という従来の二元型モデルを、連続性のあるスペクトルとして再定義するものです。我々は、EMTのシグネチャーとスコアリングのメカニズムを確立することで、腫瘍不均一性におけるEMTの中核的役割を解明します。さらに、我々の関心は3Dゲノムレベルにまで及んでおり、そこでEMTスペクトラムの複雑な制御にも光を当てています。

卵巣癌研究ではこれまでに、上皮性および間葉性の特徴や化学療法に対する反応が異なる5つの分子サブタイプを明らかにしてきました。さらに、非古典的FZD7-Wntシグナル伝達経路やAXLシグナル伝達経路といった重要な経路を同定し、個別化治療戦略の基盤を構築してきました。さらに、MASH（Molecular Assessment of Subtype Heterogeneity：サブタイプ不均一性の分子評価）などを通じて、腫瘍内の不均一性を深く掘り下げ、オーダーメイド治療への道を開くことを目指しています。

さらに我々は、最先端の空間ゲノミクス技術を通じて、腫瘍組織内の内不均一性を解明しようとする試みを開始しています。例えばnanoStringデジタル空間プロファイリング（DSP）GeoMxシステム、10X Visiumシステムといった最先端のプラットフォームを駆使し、腫瘍の微小環境や上皮間葉形質の可塑性を詳細に解析しています。

我々の学際的なチームは腫瘍学、病理学、臨床腫瘍学の専門知識を備えた多彩なスタッフで構成され、科学的理解を深め、また、発見を革新的な治療戦略につなげるべく、互いを高め合いながら協力して研究に取り組んでいます。我々の研究は、卵巣癌の治療戦略に革命をもたらし、空間的な観点からの腫瘍生物学の理解を深めることにつながるものと期待されます。

論文一覧

  1. Huang RY, Huang KJ, Chen KC, Hsiao SM, Tan TZ, Wu CJ, Hsu C, Chang WC, Pan CY, Sheu BC, Wei LH. (2023) Immune-Hot tumor features associated with recurrence in early-stage ovarian clear cell carcinoma. Int J Cancer. 152(10):2174-2185.
  2. Yu SC, Chen KC, Huang RY. (2023) Nodal reactive proliferation of monocytoid B-cells may represent atypical memory B-cells. J Microbiol Immunol Infect. 56(4):729-738.
  3. Yeo XH, Sundararajan V, Wu Z, Phua ZJC, Ho YY, Peh KLE, Chiu YC, Tan TZ, Kappei D, Ho YS, Tan DSP, Tam WL, Huang RY. (2023) The effect of inhibition of receptor tyrosine kinase AXL on DNA damage response in ovarian cancer. Commun Biol. 6(1):660.
  4. Tai YT, Lin WC, Wang DYT, Ye J, Tan TZ, Wei LH, Huang RYJ. (2023) Spatial profiling of ovarian clear cell carcinoma (OCCC) and identification of immune-hot features. Journal of Clinical Oncology. 41 (16_suppl), e17543-e17543.
  5. Pang QY, Tan TZ, Sundararajan V, Chiu YC, Chee EYW, Chung VY, Choolani MA, Huang RY. (2022) 3D genome organization in the epithelial-mesenchymal transition spectrum. Genome Biol. May 30;23(1):121.
  6. PY Chu, APF Koh, J Antony, RYJ Huang. (2022) Applications of the Chick Chorioallantoic Membrane as an Alternative Model for Cancer Studies. Cells Tissues Organs. 211 (2), 222-237
  7. Heong V, Tan TZ, Miwa M, Ye J, Lim D, Herrington CS, Iida Y, Yano M, Yasuda M, Ngoi NY, Wong SJ, Okamoto A, Gourley C, Hasegawa K, Tan DS, Huang RY. (2021) A multi‐ethnic analysis of immune‐related gene expression signatures in patients with ovarian clear cell carcinoma. Journal of Pathology. 255 (3), 285-295
  8. Sundararajan V, Tan M, Zea Tan T, Pang QY, Ye J, Chung VY, Huang RY. (2020) SNAI1-Driven Sequential EMT Changes Attributed by Selective Chromatin Enrichment of RAD21 and GRHL2. Cancers (Basel). May 2;12(5):1140.
  9. Chung VY, Tan TZ, Ye J, Huang RL, Lai HC, Wollmann H, Guccione E, Huang RY. (2019) The role of GRHL2 and epigenetic remodeling in epithelial–mesenchymal plasticity. Commun Biol. Jul 24;2:272.
  10. Tan TZ, Ye J, Yee CV, Lim D, Ngoi NYL, Tan DSP, Huang RY. (2019) Analysis of gene expression signatures identifies prognostic and functionally distinct ovarian clear cell carcinoma subtypes. EBioMedicine. Dec;50:203-210
黃 韻如　客員教授
Ruby Yun-Ju Huang
Ph. D.