胡桃坂研究室:KURUMIZAKA LABORATORY

【発表論文】"Heme protein identified from scaly-foot gastropod can synthesize pyrite (FeS2) nanoparticles."を発表しました。
論文はこちら
2023.03.20
【発表論文】"High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Spontaneous Nucleosome Sliding of H2A.Z at the Subsecond Time Scale."を発表しました。
論文はこちら
2023.03.20
【発表論文】"The cryo-EM structure of full-length RAD52 protein contains an undecameric ring."を発表しました。
論文はこちら
2023.03.20
【受賞】胡桃坂先生が 2022年度上原記念生命科学財団上原賞を受賞しました！！！受賞講演がライブで配信されます！
詳細はこちらへどうぞ！

2023.01.18
最新論文"Structural basis of RNA polymerase II transcription on the chromatosome containing linker histone H1"がNature CommunicationsのEditors’ Highlightsに選出されました！
詳細はこちらへどうぞ！
2023.01.18
【イベント】国際シンポジウム「Chromatin Architecture: Structure and Function」のご案内 2023/01/24-25
ERATO胡桃坂クロマチンアトラスプロジェクトでは、2023年1月24-25日に「Chromatin Architecture: Structure and Function」というタイトルで国際シンポジウムをオンライン開催いたします。みなさまのご参加をお待ちしております。ポスターの要旨の提出期限は 2023年1月9日です。
詳細はこちらへどうぞ！
2022.12.07
【発表論文】"Structural basis of RNA polymerase II transcription on the chromatosome containing linker histone H1"を発表しました。
論文はこちら
2022.11.27
【受賞】畠澤卓特任研究員、博士1年赤津綜隆くん、修士1年大石匠美くんが令和4年度新学術・学術変革領域A合同「若手の会2022」にて優秀発表賞を受賞しました。おめでとうございます！
詳細はこちらへどうぞ！

2022.11.14
【イベント】国際セミナーのご案内 2022/11/25
The Rockefeller University (米国) のHironori Funabiki博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2022.11.07
【発表論文】"Cryo-electron microscopy structure of the H3-H4 octasome: A nucleosome-like particle without histones H2A and H2B."を発表しました。
論文はこちらプレスリリース記事はこちらへどうぞ！
・東京大学定量生命科学研究所プレスリリース 2022年11月8日付
 ・東京大学プレスリリース 2022年11月8日付
 ・東京工業大学プレスリリース 2022年11月8日付
 ・JST プレスリリース 2022年11月8日付

2022.11.04
【イベント】サイエンスアゴラ2022「トップ研究者に100の質問！」のご案内　2022/11/06
11月6日（日）テレコムセンタービル現地開催のサイエンスアゴラ2022「トップ研究者に100の質問！」企画に、胡桃坂先生をはじめとしたERATO胡桃坂クロマチンアトラスプロジェクトのメンバーが登壇します。
この企画では、中高生20名(先着)がステージ周辺の座席から、登壇者と対話をすることができます。
・ERATO企画申込みフォームはこちらから
・参加希望の方は、サイエンスアゴラの入場登録(無料)もこちらからお願いいたします。
詳細はチラシ及びサイエンスアゴラHPをご覧ください。

2022.10.17
【延期】国際セミナー延期のご案内
10月28日(金曜日)に予定しておりました、Saadi先生を講師にお招きするERATO国際セミナーですが、事情により開催延期となりましたことをお知らせいたします。
お忙しい中、ご参加をお決め頂いた方、並びにご参加をご検討頂いている方には、このようなお知らせとなってしまい大変申し訳ありません。
何卒ご理解とご了承を賜りますようお願い申し上げます。
現時点では変更後の開催日は未定です。改めてSaadi先生のセミナー開催日が決まりましたら、再度ご案内をさせて頂きます。
どうぞよろしくお願いいたします。
2022.10.11
【イベント】国際セミナーのご案内 2022/10/28 Institute for Advanced Biosciences (フランス) のSaadi Khochbin博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2022.09.30
【発表論文】"Evolution of nacre- and prisms-related shell matrix proteins in the pen shell, Atrina pectinata."を発表しました。
論文はこちら
2022.09.15
【発表論文】"Structural basis for p53 binding to its nucleosomal target DNA sequence."を発表し、プレスリリースを行いました。
論文はこちら
プレスリリース記事はこちらへどうぞ！
・東京大学定量生命科学研究所プレスリリース 2022年9月6日付
 ・東京大学プレスリリース 2022年9月6日付
 ・日本経済新聞プレスリリース 2022年9月6日付

2022.9.06
【発表論文】"Structural basis of nucleosome disassembly and reassembly by RNAPII elongation complex with FACT."を発表し、プレスリリースを行いました。
論文はこちら
プレスリリース記事はこちらへどうぞ！
・東京大学定量生命科学研究所プレスリリース 2022年8月19日付
 ・理化学研究所プレスリリース 2022年8月19日付

2022.8.19
【発表論文】"Chromatin structure meets cryo-EM: Dynamic building blocks of the functional architecture."を発表しました。
論文はこちら
2022.08.17
【イベント】国際セミナーのご案内 2022/9/7 Research center of Institut Curie, Paris, FranceのGeneviève Almouzni博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2022.08.17
【発表論文】"Nucleosome Structures Built from Highly Divergent Histones: Parasites and Giant DNA Viruses."を発表しました。
論文はこちら
2022.08.03
【発表論文】"Method for Evaluating Effects of Non-coding RNAs on Nucleosome Stability."を発表しました。
論文はこちら
2022.7.15
【発表論文】"Evolution of EGF-like and Zona pellucida domains containing shell matrix proteins in mollusks."を発表しました。
論文はこちら
2022.7.15
【受賞】博士1年赤津綜隆くんが第二十一回東京大学生命科学シンポジウムにて優秀ポスター賞を受賞しました。おめでとうございます！
詳細はこちらへどうぞ！

2022.6.23
【イベント】国際セミナーのご案内 2022/7/19　 Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences (中国) のGuohong Li博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2022.06.15
【発表論文】"Structural basis for binding diversity of acetyltransferase p300 to the nucleosome."を発表し、プレスリリースを行いました。
論文はこちら
プレスリリース記事はこちらへどうぞ！
・東京大学定量生命科学研究所プレスリリース 2022年6月10日付
 ・JST プレスリリース 2022年6月10日付
 ・AMED プレスリリース 2022年6月10日付
 ・日本経済新聞プレスリリース 2022年6月10日付

2022.6.10
【受賞】博士1年福島友太郎くんがOutstanding Poster Award of the 2022 WINGS-LST/SPRING-GX general meetingを受賞しました。おめでとうございます！
詳細はこちらへどうぞ！

2022.6.10
【イベント】国際セミナーのご案内 2022/5/26　　　 Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology (オーストリア) のFrederic Berger博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2022.05.24
【発表論文】"Structural and biochemical analyses of the nucleosome containing Komagataella pastoris histones."を発表しました。
論文はこちら
2022.4.30
【受賞】鯨井智也助教が令和4年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞を受賞しました。おめでとうございます！
詳細はこちらへどうぞ！
定量研ホームページ
 東京大学ホームページ

2022.4.25
【受賞】博士1年赤津綜隆くんが令和３年度理学系研究科研究奨励賞(修士)を受賞しました。おめでとうございます！
詳細はこちらへどうぞ！

2022.4.5
【発表論文】"Organoruthenium-catalyzed chemical protein synthesis to elucidate the functions of epigenetic modifications on heterochromatin factors."を発表しました。
論文はこちら
2022.4.5
【発表論文】"Characteristic H3 N-tail dynamics in the nucleosome core particle, nucleosome, and chromatosome."を発表しました。
論文はこちら
2022.3.19
【発表論文】"Structural insight into replicative helicase loading in Escherichia coli."を発表しました。
論文はこちら
2022.3.19
【発表論文】"Structural studies of functional nucleosome complexes with transacting factors."を発表しました。
論文はこちら
2022.1.13
最新の論文が新聞等で紹介されました！
・九州大学プレスリリース 2021年2月21日付
 ・大阪市立大学プレスリリース 2021年12月21日付
 ・東京大学定量生命科学研究所プレスリリース 2021年12月21日付
 ・JST プレスリリース 2021年12月21日付
 ・AMED プレスリリース 2021年2月21日付
 ・日本経済新聞プレスリリース 2021年12月21日付

2022.1.13
【イベント】国際セミナーのご案内 2022/2/1　　　 Max Planck Institute of Biochemistry (ドイツ) のKikuë Tachibana博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2021.12.24
【発表論文】"Unusual nucleosome formation and transcriptome influence by the histone H3mm18 variant."を発表しました。
論文はこちら
2021.12.21
LIVE映像『毎日がPCRライブ@横浜』を公開しました。
視聴はこちらから
2021.12.8
【受賞】博士3年西村正宏くん、平野里奈さんが第94回日本生化学会大会にて若手優秀発表賞を受賞しました。おめでとうございます！
詳細はこちらへどうぞ！

2021.11.11
【イベント】国際セミナーのご案内 2021/11/24　　　 Hubrecht Institute/Oncode Institute(オランダ)のPuck Knipscheer博士による国際セミナーがオンラインで開催されます。
詳細・参加登録はこちらへどうぞ！
2021.11.9
【発表論文】"Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL-seq with single thin sections."を発表しました。
論文はこちら
2021.11.5
【プレプリント】"Cryo-electron microscopy structure of the H3-H4 octasome without histones H2A and H2B."を発表しました。
論文はこちら
2021.10.29
"Editorial overview: New insights and complexities for chromatin interacting proteins."を発表しました。
詳細はこちら
2021.10.28
【発表論文】"Neural stem/precursor cells dynamically change their epigenetic landscape to differentially respond to BMP signaling for fate switching during brain development."を発表しました。
論文はこちら
2021.10.28
楽曲『毎日がPCR』を公開しました。
視聴はこちらから
2021.10.22
【イベント】サイエンスアゴラに出展 2021/11/6
サイエンスアゴラ2021についてはこちらにて公開されています。出展の詳細・事前登録はこちらへどうぞ！。
2021.10.20
【発表論文】"Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing Giardia lamblia histones."を発表しました。
論文はこちら
2021.8.6
【受賞】"Linker DNA and histone contributions in nucleosome binding by p53"がJB論文賞に選ばれました。
詳しくは生化学会HPにて公開されています。

2021.7.19
【発表論文】"Structural basis for DNA sequence recognition by pioneer factors in nucleosomes."を発表しました。
論文はこちら
2021.7.6
【発表論文】"The N-terminal tails of histones H2A and H2B adopt two distinct conformations in the nucleosome with contact and reduced contact to DNA."を発表しました。
論文はこちら
2021.6.30
【発表論文】"Chromatin structure-dependent histone incorporation revealed by a genome-wide deposition assay."を発表しました。
論文はこちら
2021.5.25
【受賞】胡桃坂先生が令和3年度科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞研究部門を受賞しました！
文部科学省HPにてプレスリリースが掲載されています。
2021.4.7
最新の論文が新聞等で紹介されました！
・金沢大学プレスリリース 2021年2月25日付
 ・京都大学プレスリリース 2021年2月22日付
 ・定量生命科学研究所プレスリリース 2021年2月17日付
 ・JST プレスリリース 2021年2月16日付
 ・AMED プレスリリース 2021年2月16日付
 ・日本経済新聞プレスリリース 2021年2月16日付

2021.2.26
【発表論文】"H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing."を発表しました。
論文はこちら
2021.2.20
【発表論文】"Histone variant H2A.B-H2B dimers are spontaneously exchanged with canonical H2A-H2B in the nucleosome."を発表しました。
論文はこちら
2021.2.20
【発表論文】"Structural basis of nucleosomal histone H4 lysine 20 methylation by SET8 methyltransferase."を発表しました。
論文はこちら
2021.2.20
【発表論文】"Live-cell epigenome manipulation by synthetic histone acetylation catalyst system."を発表しました。
論文はこちら
2021.1.21
【発表論文】"Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome in complex with phosphorylated CENP-C."を発表しました。
論文はこちら
2021.1.21
【発表論文】"Essentiality of CENP-A Depends on Its Binding Mode to HJURP."を発表しました。
論文はこちら
2020.12.23
【発表論文】"Acetylation-modulated communication between the H3 N-terminal tail domain and the intrinsically disordered H1 C-terminal domain."を発表しました。
論文はこちら
2020.11.1
【発表論文】"Contributions of histone variants in nucleosome structure and function."を発表しました。
論文はこちら
2020.11.1
胡桃坂先生が2020年度持田記念学術賞を受賞しました！
持田記念医学薬学振興財団HPにてプレスリリースが掲載されています。
2020.10.28
【受賞】修士1年赤津綜隆くんが生化学若い研究者の会第60回生命科学夏の学校にて優秀賞 (修士部門)を受賞しました。

2020.9.14
最新の論文が新聞等で紹介されました！
・日経新聞 2020年9月11日付
 ・日経バイオテク 2020年9月11日付

2020.9.11
【発表論文】"Structural basis for the inhibition of cGAS by nucleosomes."を発表しました。
論文はこちら
2020.9.11
【発表論文】"Interaction of the pioneer transcription factor GATA3 with nucleosomes."を発表しました。
論文はこちら
2020.8.20
【発表論文】"Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input."を発表しました。
論文はこちら
2020.8.20
【発表論文】"Acetylated histone H4 tail enhances histone H3 tail acetylation by altering their mutual dynamics in the nucleosome."を発表しました。
論文はこちら
2020.8.20
【発表論文】"Linker DNA and histone contributions in nucleosome binding by p53"を発表しました。
論文はこちら
2020.7.28
【発表論文】"Nucleosome binding by the pioneer transcription factor OCT4"を発表しました。
論文はこちら
2020.7.20
【発表論文】"Integral Approach to Biomacromolecular Structure by Analytical-Ultracentrifugation and Small-Angle Scattering."を発表しました。
論文はこちら
2020.6.10
【発表論文】"The N-terminal and C-terminal Halves of Histone H2A.Z Independently Function in Nucleosome Positioning and Stability."を発表しました。
論文はこちら
2020.6.8
【メンバー】欄の主な就職先を更新しました。

2020.5.19
【発表論文】"Improved Methods for Preparing the Telomere Tethering Complex Bqt1-Bqt2 for Structural Studies."を発表しました。
論文はこちら
2020.03.10
【アルバム】更新しました。

2020.2.18
【発表論文】"Nucleosome destabilization by nuclear non-coding RNAs."を発表しました。
論文はこちら
2020.02.13
【発表論文】"Native mass spectrometry of protein and DNA complexes prepared in non-volatile buffers."を発表しました。
論文はこちら
2020.02.03
”Cryo-EM Structures of Centromeric Tri-nucleosomes Containing a Central CENP-A Nucleosome.”がStructure誌のPreviewに取り上げられました！

2020.1.20
【発表論文】"Structural Studies of Overlapping Dinucleosomes in Solution."を発表しました。
論文はこちら
2020.01.20
【アルバム】更新しました。

2020.1.10
【発表論文】"Biochemical and structural analyses of the nucleosome containing human histone H2A.J."を発表しました。
論文はこちら
2019.12.05
【発表論文】"Transcription through the nucleosome."を発表しました。
論文はこちら
2019.11.30
【発表論文】"Incorporation and influence of Leishmania histone H3 in chromatin."を発表しました。
論文はこちら
2019.11.13
【発表論文】"Cryo-EM Structures of Centromeric Tri-nucleosomes Containing a Central CENP-A Nucleosome."を発表しました。
論文はこちら
2019.11.12
【発表論文】"Structure determination of the nucleosome core particle by selenium SAD phasing."を発表しました。
論文はこちら
2019.10.10
戦略的創造研究推進事業総括実施型研究（ＥＲＡＴＯ）「胡桃坂クロマチンアトラスプロジェクト」が開始しました。
プレスリリースはこちら
2019.10.1
【受賞】鯨井智也助教が2019年度日本生化学会奨励賞を受賞しました。

2019.9.21
【受賞】博士1年西村正宏くんが第92回日本生化学会大会にて若手優秀発表賞を受賞しました。

2019.9.21
【発表論文】"A novel mode of DnaA-DnaA interaction promotes ADP dissociation for reactivation of replication initiation activity."を発表しました。
論文はこちら
2019.9.20
楽曲『生命（ライフ）』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.9.13
楽曲『マンモスソング』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.9.10
楽曲『グロリア』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.9.4
【発表論文】"H3K14 ubiquitylation promotes H3K9 methylation for heterochromatin assembly."を発表しました。
論文はこちら
2019.9.3
「あなたのタンパク質精製、大丈夫ですか？」の販促MVをメディアのページにアップロードしました。
視聴はこちら
2019.9.3
【発表論文】"Structural transition of the nucleosome during chromatin remodeling and transcription"を発表しました。
論文はこちら
2019.8.30
【発表論文】"Biochemical analysis of nucleosome targeting by Tn5 transposase."を発表しました。
論文はこちら
2019.8.15
楽曲『Stand up』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.7.29
【発表論文】"Intrabody-based FRET probe to visualize endogenous histone acetylation."を発表しました。
論文はこちら
2019.7.15
楽曲『Southern Islands』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.7.4
胡桃坂先生が広島大学統合生命科学研究科開設記念シンポジウムにて講演を行いました。
詳しくは広島大学大学院統合生命科学研究科HPにて公開されています。
2019.7.4
楽曲『3月27日』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.6.18
【発表論文】"Structure-based design of an H2A.Z.1 mutant stabilizing a nucleosome in vitro and in vivo."を発表しました。
論文はこちら
2019.6.9
【発表論文】"DNA damage detection in nucleosomes involves DNA register shifting."を発表しました。
論文はこちら
2019.5.30
【受賞】当研究室の鯨井智也助教が第13回日本エピジェネティクス研究会年会にて奨励賞を受賞しました。

2019.5.30
楽曲『スマイル』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.5.24
【発表論文】"Structural and biochemical analyses of the nuclear pore complex component ELYS identify residues responsible for nucleosome binding."を発表しました。
論文はこちら
2019.5.4
【発表論文】"Biochemical characterization of the placeholder nucleosome for DNA hypomethylation maintenance."を発表しました。
論文はこちら
2019.4.23
【メンバー】更新しました。

2019.4.2
【アルバム】更新しました。

2019.3.27
【アルバム】更新しました。

2019.3.18
楽曲『人類創生』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.3.14
NHKにてRNA polymerase IIとnucleosomeの複合体についての研究が紹介されました。

2019.3.5
【メディア】NHK高校講座　生物基礎第40回「生物学と人類の未来」が放送されました。
胡桃坂先生による講義がNHKのサイトにて公開されています。
2019.2.19
【アルバム】更新しました。

2019.2.18
【発表論文】"Structural insight into nucleosome transcription by RNA polymerase II with elongation factors."がScienceに掲載されました。
論文はこちら
2019.2.18
楽曲『Go around!』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.2.15
ミレニアル応援ソング『未来の自分はこの手の中にある』がGEヘルスケアのサイトからも公開されました。
GEヘルスケアのサイトでも視聴できます。
2019.1.26
楽曲『未来の自分はこの手の中にある』を公開しました。
視聴はこちらから
2019.1.24
楽曲『とびら』を公開しました。
視聴はこちらから
2018.12.20
Twitterはじめました。

2018.10.20
第13回柿内三郎記念賞/第26回JB論文賞受賞式が行われました。

2018.9.24
【メディア】NHK高校講座　生物基礎第15回「遺伝子の発現と生命現象」が放送されました。
胡桃坂先生による講義がNHKのサイトにて公開されています。
2018.7.17
【メディア】NHK高校講座　生物基礎第14回「セントラルドグマ」が放送されました。
胡桃坂先生による講義がNHKのサイトにて公開されています。
2018.7.10
【受賞】胡桃坂先生が第13回柿内三郎記念賞を受賞しました。
詳しくは生化学会HPにて公開されています。
2018.7.5
【発表論文】"Influence of polynucleosome preparation methods on sedimentation velocity analysis of chromatin"がJB論文賞に選ばれました。
詳しくは生化学会HPにて公開されています。
2018.7.5
【メディア】NHK高校講座　生物基礎第9回「DNAとゲノム」が放送されました。
胡桃坂先生による講義がNHKのサイトにて公開されています。
2018.6.5
【メディア】NHK高校講座　生物基礎第8回「生物と遺伝子」が放送されました。
胡桃坂先生による講義がNHKのサイトにて公開されています。
2018.6.1
6月16日（土）、東京大学大学院理学系研究科の大学院入試説明会にて、研究室紹介を行います。
詳しくはこちら
2018.4.21
胡桃坂研究室は早稲田大学から東京大学定量生命科学研究所へ異動しました。

2018.4.1
楽曲『ホモ・サピエンス』を公開しました。
視聴はこちらから
2018.2.24
楽曲『Nucleosome song』、『染色体ラプソディー』、『ときめき』を公開しました。
視聴はこちらから
2018.1.26
最新の論文が新聞で紹介されました！
・科学新聞 2018年1月19日付
 ・沖縄タイムス 2018年1月12日付

2018.1.19
最新の論文が新聞等で紹介されました！
・日本経済新聞 2018年1月15日付
 ・早稲田大学プレスリリース 2018年1月12日
 ・基礎生物学研究所プレスリリース 2018年1月11日
2018.1.16
ホームページをリニューアルしました！

2017.10.30