88IQB HANDBOOKResearch Division for Quantitative Life Sciences私たちの研究室では、特定の生物や個別の問題にフォーカスした従来の生物学から、俯瞰的なデータサイエンスへと変貌する生物学への大きな流れに注目しています。そして、バイオインフォマティクス、理論・数理、実験、フィールドサンプリング、また他分野の技術や手法も含めたあらゆるアプローチを先入観なく取り入れつつ、生命の進化や生態に新たな光を当てる研究、そして多様な生命が持つ未知の機能を解明し活用する研究に取り組んでいます。現在は特に、以下の研究テーマに取り組んでいます。１．生命システム進化学（ゲノムや生命システムの進化に関する新たな原理・法則の解明）２．エコシステム戦略学（生態系が構築・維持される新たな原理・法則の解明）３．DNA配列空間学・未知生物ゲノム学（未培養微生物・非モデル生物・機能未知配列が持つ新規機能の解明と活用）４．対偶遺伝学・二次元オーミクス（大規模データのメタ解析・階層横断的解析による新たな生命機能・生物学概念の発見）５．遺伝子誕生学（「この広い地球上で遺伝子は今どれだけ生まれているのか？」を真剣に考察する）６．これらの研究分野を革新するための技術開発（本質的に新たな謎を解くための実験技術・バイオインフォマティクス技術開発）バイオインフォマティクス研究分野Laboratory of Bioinformatics准教授（兼務） 岩崎 渉 / 博士（科学）IWASAKI Wataru (Ph. D.), Associate Professor所属:Affiliation : 統合的アプローチで生命の進化・生態・未知機能を解明するResearch Division for Quantitative Life SciencesMy lab developing and applying functional genomics approaches for mapping genetic, and chemical-genetic interactions on a large scale. We developed an automated form of yeast genetics and applied it to the construction of all 18 million yeast double mutants to map ̃550,000 negative and ̃350,000 positive. A comprehensive set of genetic interaction pro les maps a model of cellular function in which each gene is placed within a functional hierarchy. This model of cell function can be used to interpret chemical-genetic interaction proles for bioactive compounds, thereby linking them to target bioprocesses and pathways. The global yeast digenic interaction map can be expanded to more complex genetic interactions, such as trigenic interactions, di erent conditions, and di erent genetic backgrounds. We are also mapping genetic interaction networks with human cells using newly-developed CRISPR-Cas9 approaches for genome-wide genetic perturbation, and our preliminary results suggest that many of the general principles discovered with the global yeast genetic interaction network are highly conserved. Ultimately, we hope to discover genetic interactions underlying inherited phenotypes in human genotyping data, and we attempting to develop new computational approaches for discovering gene pairs that are associated with human disease.遺伝子ネットワーク研究分野Laboratory of Genetic networks客員教授 Charles BooneCharles Boone, Visiting Professor東京大学 大学院理学系研究科Graduate School of Science, UTokyo所属:Affiliation : 理化学研究所RIKEN
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